| 序号 | 业务内容 | 办理部门 | 办理时间 | 办公地点 | 办公电话 | |
| 1 | 贯彻落实重大决策部署，开展督办检查；保障日常工作秩序和内外政务协调联络；开展机要档案、信息、科技、后勤保障等工作；财务综合保障接洽；承办上级海关和关党委交办的其他工作事项。 | 办公室 （党委办公室） | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区疏港大道1-2号 | 025-84423973 025-84475642 | |
| 2 | 承担干部人事、工资福利等管理工作；开展教育培训；推进基层党建、文化宣传、准军事化队伍建设、党风廉政建设；组织群团工作；承办上级海关和关党委交办的其他工作事项。 | 人事政工科 （党委组织宣传部） | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区疏港大道1-2号 | 025-84476919 025-84476912 | |
| 3 | 开展重大决策合规审核；承担法制管理、法治教育、普法宣传、知识产权海关保护等工作；办理“两简”案件；承办行政复议、行政诉讼案件相关工作；开展执法评估；联系协调内外部审计、上级督察事宜；开展执法监督、内部控制、内部审计。承办上级交办的其他工作事项。 | 法规科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区疏港大道1-2号 | 025-84423972 025-84476909 | |
| 4 | 落实国家贸易管制措施；承担归类、价格、原产地等税收征管要素管理；规范申报管理；税款征收、税款担保、退补税综合管理；签证管理；现场验估、报关单单证审核等工作；承担暂时进出口、滞报金减免、修撤单、直接退运等业务核批工作；开展税收分析；检验检疫申请评审。承办上级交办的其他工作事项。 | 综合业务科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区疏港大道1-2号 | 025-84423952 025-68285753 | |
| 5 | 承担口岸监管业务日常运行监控指挥；监管场所管理、巡查；口岸相关服务单位、口岸储存场地的卫生监督；口岸医学媒介生物监测；口岸植物疫情监测和调查。开展口岸相关服务单位卫生许可的相关工作。承办上级交办的其他工作事项。 | 监管一科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区疏港大道1-2号 | 025-84423471 025-84423447 | |
| 6 |
| 监管二科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区疏港大道1-2号 | 025-84423451 025-84423473 | |
| 7 | 审核贸易统计数据；编制业务统计数据；开展业务统计及贸易统计分析、监测预警、统计调查、贸易调研、统计监督；承担报关单数据管理、理单管理；开展政策研究；推进企业信息公共服务平台建设；承担业务风险防控工作并对接上级风险防控部门。承办上级交办的其他工作事项。 | 统计分析科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区疏港大道1-2号 | 025-84423954 025-84423783 | |
| 8 | 承担集装箱货物机检查验、智能审像工作；进境集装箱、货物的核生化监测与排查处置；进境集装箱、货物的预防性检疫处理及监管工作；集装箱适载检验；H986系统设备和辐射探测设备管理等工作。承办上级交办的其他工作事项。 | 货物查验一科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区龙潭港区集装箱码头 | 025-84475881 025-84423874 | |
| 9 | 承担水运集装箱货物、包装、集装箱及分运行李的人工查验、检验、检疫；有害生物初筛鉴定；集装箱货物的倒箱、申报前看货监管；查验设备管理；检验、检疫异常情况现场技术整改、检疫处理监管；转关、查验分流、先进区后报关现场施封等工作。承办上级交办的其他工作事项。 | 货物查验二科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区龙潭港区集装箱码头 | 025-84423945 025-84476911 025-84476907 | |
| 10 | 承担非集装箱装载货物、包装、铺垫材料的查验、检验、检疫；铁路集装箱货物的查验、检验、检疫、转关施封工作；检验、检疫异常情况的现场技术整改和检疫处理监管；查验设备管理等工作。承办上级交办的其他工作事项。 | 货物查验三科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区兴智路6号兴智科技园A幢223 | 025-84423942 025-84476915 | |
| 11 | 承担进出境舱单管理；转关运输管理；危险品疏港分流管理；报关单结关管理；超期未报货物管理；空箱调拨、重箱出场、申报前看货审批等工作。承办上级交办的其他工作事项。 | 物流管理科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区疏港大道1-2号 | 025-84476920 025-84423924 | |
| 12 | 承担运输工具申报管理、船舶吨税征收；南京港国际航行船舶的检疫、检查、签证放行、卫生监督；船员、旅客及其行李的检疫、检查、传染病监测；供船物料管理；船舶除害处理监管等工作。承办上级交办的其他工作事项。 | 运输工具监管科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区兴智路6号兴智科技园A幢223 | 025-84476602 025-84475461 | |
| 13 | 承担国际快件运营人、跨境电商企业、商品备案；快件及跨境电商货物查验、检验、检疫；查验异常处置；快件及跨境电商监管场所管理等工作。承办上级交办的其他工作事项。 | 快件监管科 | 9:00-11:45 12:45-16:00 （二班制） | 南京市栖霞区平港路1号 | 025-84476908 025-84423316 |
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